فرهاد رهبر فعالیت برخی استادان اخراج شده را به‌دلیل پاره وقت بودن، غیرقانونی دانسته است این در حالی است که بنا بر برخی خبرها فهرستی ۵۰۰ نفره در زمینه تعدیل نیروی استادان دانشگاه آماده شده و آنها در شرف قطع همکاری با دانشگاه آزاد اسلامی هستند. از زمان ریاست ولایتی بر هیات امنای دانشگاه آزاد، این دانشگاه روزهای سرشار از تغییرات معاونان، مدیران و این اواخر، استادان را سپری می‌کند. صادق زیباکلام استاد تعدیل شده از دانشگاه آزاد در واکنش به غیرقانونی بودن فعالیت پاره وقت در این دانشگاه ضمن سیاسی خواندن این اقدام گفته پس تکلیف وزیر، معاون وزیر، مشاور وزیر، استاندار و خیل عظیمی از استادان دانشگاه که پست‌ها و سمت‌های دولتی دارند یا با سازمان‌های دولتی همکاری می‌کنند، چه می‌شود؟ در همین زمینه جمعی از دانشجویان دانشگاه آزاد در نامه‌ای به رئیس‌جمهور و شورای‌عالی انقلاب فرهنگی برخی از تصمیمات دوره جدید مدیریت در دانشگاه آزاد را ناشی از رویکردهای غیرتخصصی و احیانا سیاسی عنوان کرده‌اند. در همین حال منصور غلامی، وزیر علوم هم در گفت‌وگویی اقدام اخیر دانشگاه آزاد را «غیرسیاسی» خوانده است.